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DNAマイクロアレイ解析受託

SNPジェノタイピング

Illumina iScanを用いた高精度・大規模・高速 Genotyping

トランスジェニック社では、Illumina社の最新スキャナー iScan、最新の同社Genotypingアレイ HumanOmniシリーズを用いて、高精度・大規模なGenotyping遺伝子解析受託サービスを提供致します。

Illumina iScan

概要

当社では、Illumina社の最新型マイクロアレイスキャナー"iScan"を導入致しました。
iScanは高品質なレーザー、光学系、検出器を備えた最新のマイクロアレイスキャナーで、あらゆるアプリケーションに対して最高のパフォーマンスを発揮します。
スキャン速度は従来機の約6倍で、大規模なプロジェクトにおいては、納期の大幅な短縮に繋がります。

SNP解析

SNPは、人種や家系により医薬品との適合性に違いがあることは既に広く知られており、「オーダーメイド医療」や「テーラーメイド医療」等新たな医療を開くための鍵となっています。

トランスジェニック社の遺伝子解析受託サービスでは最小単位4サンプルよりお請け致します。
※4サンプル以下でも、別途ご相談いたしますので、お問合わせください。

Custom (Focus) SNP

GoldenGate™ Assay:96, 384,768,1536plex (96サンプル単位)
アリル特異的な一塩基伸長反応とユニバーサルPCRテクノロジーを用い、一度に96~1536 SNPsローカスまでのマルチプレックス反応が可能です。

Whole genome

Infinium™ Assay
ホールゲノム解析のための方法です。SNPローカスをエクソンセントリックに選択してあります。

特徴

Custom (Focus) SNP genotyping

GoldenGate™ Assay法を使用。

・BeadArray™ をベースに行うアッセイ。
アリル特異的な伸長反応とユニバーサルPCRテクノロジーを用い、一度に96~1536 SNPsローカスまでのマルチプレックス反応が可能。

2つのローカス特異的配列とアリル特異的な配列をもつプライマー3種を用いてゲノムDNAに直接伸長反応&ライゲーション。
合成されたイルミコードをもつアンプリコンを共通プライマーでPCR増幅、イルミコードのみをプローブに持つユニバーサルアレイとハ  イブリダイゼーションによりスクリーニング。
・Locus数:96, 384
・対応サンプル数:96の倍数

Whole genome genotyping

Infinium™ Assay法を使用。

・BeadArray™ をベースに行うアッセイ。
 アリル特異的な配列をもつ同一プローブ2組で、ローカスに対応する塩基のみ異なる1或いは2BeadTypeを鋳型に、一塩基伸長法に よりチップ上で特異的ローカスをスクリーニング。
・対応サンプル数:4の倍数

Platform

Whole genome genotyping
・HumanOmni5
・HumanOmni2.5s-8
・HumanOmni1s-8
など

HumanOmni5-Quad

HumanOmni2.5-Quad

もっとも包括的なゲノムカバレッジをもち、国際HapMapからのtagSNPと、1%までのアリル頻度をターゲットとした1000人ゲノムプロジェクトからのマーカーを搭載(約450万プローブ)。最大50万のカスタムコンテンツを追加することができ、よりターゲット化したアプリケーションや人種特異的な研究も可能。

HumanOmni2.5-8

HumanOmni2.5-Quad

1000人ゲノムプロジェクトからの高頻度および低頻度(MAF 2.5%以上)のSNPを組み合わせ、多様な人種集団をカバーする包括的な製品(約250万プローブ)。1000人ゲノムプロジェクトのパイロットデータから得られた最適化されたtag SNPを活用。コピー数多型(CNV)アプリケーションをサポートしており、強力なジェノタイピングツール。

GoldenGate Assay 解析フロー

GoldenGate Assay 解析フロー

スキャン, BeadStudio 解析(解析オプションあり)
増幅されたPCR productをハイブリダイズし、スキャナによって発現量測定

ご注文

ご注文は、96サンプル から承っております。96サンプル以下の場合は、詳しくは、お問い合わせ下さい。

納期

標準解析
96 サンプルの場合、サンプル受付日から約2ヶ月(実験日数15営業日、解析日数10営業日)です。納期は、ご注文数により大きく納期変動がございますのでお問合せ下さい。
解析結果は、DNA_Summary, Locus_Summary, Final_report, xxx_reportと共に、CD- or DVD-Rにてお客様の元に送付致します。
解析オプション
詳しくは、お問い合わせ下さい。

Infinium Assay 解析フロー

Infinium Assay 解析フロー

Scan 、画像データ化

ご注文

ご注文は、8サンプルから承っております。詳しくはお問い合わせ下さい。

納期

標準解析
サンプル受付日から約2ヶ月(実験日数15営業日+解析10営業日)です。ご注文数により大きく納期変動がございます。
解析結果は、 DNA_Summary, Locus_Summary, Final_report, xxx_reportと共に、CD- or DVD-Rにてお客様の元に送付致します。
解析オプション
詳しくは、お問い合わせ下さい。

CNV解析 / コピー数多型解析

CNV解析

染色体における増幅や欠失という染色体異常によるゲノムポロファイルは癌研究の遺伝解析分野で非常に重要になっています。
イルミナ社のInfinium Genotyping BeadChipは癌患者や先天性異常の患者から得られたサンプルを高解像度で低ノイズレベルの実験ができるようになっております。
そのInfiniumアッセイにより
・高品質のデータ
・正確度の高いコピー数
・新規及び既知のCNV領域の高いカバー率
を実現させ、CNV研究においてジェノタイピングとコピー数の統合解析を可能にしました。

※詳細については、お問合せ下さい。


お問い合わせ

遺伝子解析事業は、2015年4月に当社グループ会社「株式会社ジェネティックラボ」に承継されました。当該事業に関するお問い合わせは、(株)ジェネティックラボ営業部にお願いいたします。(参考: 遺伝子解析事業部門の事業譲渡に関するお知らせ


株式会社ジェネティックラボ 営業部
札幌市中央区北9条西15丁目28番地196
札幌ITフロントビル3F
電話:011-644-7333 FAX:011-644-7611

お問い合わせフォーム
http://www.gene-lab.com/cgi-bin/form/form.php
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